Det Maritime Oplevelsescenter og det Historiske Bådebyggeri er tilgængelige for kørestolsbrugere og gangbesværede. I Oplevelsescenteret findes en lift, der giver adgang til 1. sal og handicapvenligt toilet. Kanalfogedboligen er ikke tilgængelig med kørestol.
Mad og drikke er ikke tilladt i museets udstillinger. Det kan indtages udendørs ved de opstillede borde bænkesæt på plænen over for museet.
Museet har butik i både Det Maritime Oplevelsescenter og i Kanalfogedboligen. Der er fri adgang til museets butikker uden billet.
Pusleplads findes på toilettet i Det Maritime Oplevelsescenter.
Det er ikke tilladt at ryge på i Limfjordsmuseets udstillinger eller ombord på museets fartøjer.
Museets fartøjer GREVINDE DANNER afsejler fra broen ved Kanalfogedboligen. Andre sejladser kan starte fra broen ved Det Historiske Bådebyggeri. I så fald fremgår det af opslaget.
Museets fartøjer er med få undtagelser åbne, hvorfor det tilrådes at være klædt på efter årstiden. I tilfælde af storm eller højvande aflyses sejladsen efter skippers skøn.
Museet sejler efter gældende sikkerhedsmæssige forskrifter og er godkendt af Søfartsstyrelsen til passagersejlads.